خدمات تحلیل داده و بیوانفورماتیک با هدف تبدیل دادههای خام زیستی به خروجیهای قابل تفسیر و مستند ارائه میشوند. نوع فایل ورودی، طراحی مطالعه، نسخه نرمافزارها و خروجی مورد انتظار پیش از شروع پروژه مشخص میشوند.
هر یک از خدمات زیر بر اساس نیاز پروژه و مشخصات نمونه قابل بررسی و برنامهریزی است. برای انتخاب دقیق دامنه کار، توضیحات و نیازمندیهای پژوهش خود را آماده کنید.
طراحی توالیهای پرایمر یا پروب برای هدف ژنی مشخص با درنظرگرفتن توالی مرجع، اختصاصیت، ویژگیهای فیزیکوشیمیایی و کاربرد آزمون.
بررسی دادههای حاصل از تعیین توالی، کنترل کیفیت و تفسیر خروجی بر اساس نوع فناوری و سؤال پژوهش؛ نوع فایل خام و فرمت نتیجه باید هنگام ثبت درخواست ارائه شود.
پردازش و تحلیل دادههای توالییابی نسل جدید یا کل ژنوم، شامل مراحل متناسب با پروژه مانند کنترل کیفیت، همردیفسازی و شناسایی تغییرات ژنتیکی.
تحلیل دادههای ترنسکریپتوم برای بررسی بیان ژن، مقایسه گروهها و شناسایی ژنهای دارای بیان متفاوت بر اساس طراحی مطالعه.
پردازش دادههای توالییابی microRNA برای شناسایی و مقایسه الگوهای بیان miRNA و بررسی خروجیهای مرتبط با هدف پژوهش.
آمادهسازی و تحلیل دادههای آزمایشگاهی در GraphPad Prism، انتخاب آزمون آماری متناسب با ساختار داده و تهیه نمودارهای مناسب برای گزارش پژوهش.
مقایسه توالیها و ساخت درخت فیلوژنتیکی با روش مناسب برای بررسی روابط تکاملی؛ انتخاب مدل و روش به نوع و کیفیت توالیها وابسته است.
اندازهگیری و پردازش کمی تصاویر زیستی مانند تصاویر میکروسکوپی، باندهای ژل یا آزمونهای تصویربرداری با گردشکار قابل تکرار.
همترازکردن دو یا چند توالی DNA، RNA یا پروتئین برای شناسایی نواحی مشابه، اختلافها و موقعیتهای تغییریافته.
پیشبینی آرایشهای ثانویه احتمالی RNA از روی توالی و بررسی ساختارهایی مانند ساقه و حلقه؛ خروجی محاسباتی نیازمند تفسیر در بستر زیستی است.
شناسایی چارچوبهای خوانش باز در توالی نوکلئوتیدی و ترجمه آنها به توالی آمینواسیدی بر اساس کد ژنتیکی و جهت/چارچوب موردنظر.
پردازش دادههای فلوسایتومتری، تنظیم گیتها و تحلیل جمعیتهای سلولی بر مبنای پنل رنگآمیزی، کنترلها و پرسش پژوهشی.
مقایسه توالی پرسوجو با پایگاه داده برای یافتن توالیهای مشابه و بررسی شاخصهایی مانند درصد شباهت، پوشش و معنیداری آماری.
پاکسازی، تحلیل آماری، مصورسازی و تولید خروجیهای تکرارپذیر برای دادههای زیستی با استفاده از زبان و بستههای تخصصی R.
پیشبینی یا آمادهسازی مدل ساختاری پروتئین و ارزیابی محاسباتی برهمکنش لیگاند و هدف در داکینگ مولکولی؛ نتایج پیشبینی بهتنهایی اثباتکننده اتصال یا اثر زیستی نیستند.
نوع نمونه، تعداد، هدف آزمایش، خروجی مورد انتظار و محدودیت زمانی از اطلاعاتی هستند که به بررسی و برآورد دقیقتر درخواست کمک میکنند.