تحلیل داده و بیوانفورماتیک

خدمات تحلیل داده و بیوانفورماتیک با هدف تبدیل داده‌های خام زیستی به خروجی‌های قابل تفسیر و مستند ارائه می‌شوند. نوع فایل ورودی، طراحی مطالعه، نسخه نرم‌افزارها و خروجی مورد انتظار پیش از شروع پروژه مشخص می‌شوند.

زیرخدمات این بخش

هر یک از خدمات زیر بر اساس نیاز پروژه و مشخصات نمونه قابل بررسی و برنامه‌ریزی است. برای انتخاب دقیق دامنه کار، توضیحات و نیازمندی‌های پژوهش خود را آماده کنید.

طراحی پرایمر و پروب

طراحی توالی‌های پرایمر یا پروب برای هدف ژنی مشخص با درنظرگرفتن توالی مرجع، اختصاصیت، ویژگی‌های فیزیکوشیمیایی و کاربرد آزمون.

آنالیز تعیین توالی (DNA Sequencing)

بررسی داده‌های حاصل از تعیین توالی، کنترل کیفیت و تفسیر خروجی بر اساس نوع فناوری و سؤال پژوهش؛ نوع فایل خام و فرمت نتیجه باید هنگام ثبت درخواست ارائه شود.

تحلیل داده‌های WGS و NGS

پردازش و تحلیل داده‌های توالی‌یابی نسل جدید یا کل ژنوم، شامل مراحل متناسب با پروژه مانند کنترل کیفیت، هم‌ردیف‌سازی و شناسایی تغییرات ژنتیکی.

تحلیل داده‌های RNA-seq

تحلیل داده‌های ترنسکریپتوم برای بررسی بیان ژن، مقایسه گروه‌ها و شناسایی ژن‌های دارای بیان متفاوت بر اساس طراحی مطالعه.

تحلیل داده‌های miRNA-seq

پردازش داده‌های توالی‌یابی microRNA برای شناسایی و مقایسه الگوهای بیان miRNA و بررسی خروجی‌های مرتبط با هدف پژوهش.

تحلیل داده‌های GraphPad Prism

آماده‌سازی و تحلیل داده‌های آزمایشگاهی در GraphPad Prism، انتخاب آزمون آماری متناسب با ساختار داده و تهیه نمودارهای مناسب برای گزارش پژوهش.

ترسیم درخت فیلوژنتیکی

مقایسه توالی‌ها و ساخت درخت فیلوژنتیکی با روش مناسب برای بررسی روابط تکاملی؛ انتخاب مدل و روش به نوع و کیفیت توالی‌ها وابسته است.

تحلیل تصاویر زیستی با ImageJ

اندازه‌گیری و پردازش کمی تصاویر زیستی مانند تصاویر میکروسکوپی، باندهای ژل یا آزمون‌های تصویربرداری با گردش‌کار قابل تکرار.

هم‌ردیف‌سازی (Sequence Alignment)

هم‌ترازکردن دو یا چند توالی DNA، RNA یا پروتئین برای شناسایی نواحی مشابه، اختلاف‌ها و موقعیت‌های تغییر‌یافته.

پیش‌بینی ساختار ثانویه RNA

پیش‌بینی آرایش‌های ثانویه احتمالی RNA از روی توالی و بررسی ساختارهایی مانند ساقه و حلقه؛ خروجی محاسباتی نیازمند تفسیر در بستر زیستی است.

شناسایی ORF و ترجمه توالی نوکلئوتیدی به پروتئین

شناسایی چارچوب‌های خوانش باز در توالی نوکلئوتیدی و ترجمه آن‌ها به توالی آمینواسیدی بر اساس کد ژنتیکی و جهت/چارچوب موردنظر.

تحلیل داده‌های فلوسایتومتری با FlowJo

پردازش داده‌های فلوسایتومتری، تنظیم گیت‌ها و تحلیل جمعیت‌های سلولی بر مبنای پنل رنگ‌آمیزی، کنترل‌ها و پرسش پژوهشی.

اجرای BLAST برای شناسایی توالی‌های همولوگ

مقایسه توالی پرس‌وجو با پایگاه داده برای یافتن توالی‌های مشابه و بررسی شاخص‌هایی مانند درصد شباهت، پوشش و معنی‌داری آماری.

آنالیز داده‌های زیستی با زبان برنامه‌نویسی R

پاک‌سازی، تحلیل آماری، مصورسازی و تولید خروجی‌های تکرارپذیر برای داده‌های زیستی با استفاده از زبان و بسته‌های تخصصی R.

مدل‌سازی ساختار پروتئین و داکینگ مولکولی

پیش‌بینی یا آماده‌سازی مدل ساختاری پروتئین و ارزیابی محاسباتی برهم‌کنش لیگاند و هدف در داکینگ مولکولی؛ نتایج پیش‌بینی به‌تنهایی اثبات‌کننده اتصال یا اثر زیستی نیستند.

برای ثبت درخواست این خدمات، جزئیات پروژه خود را آماده کنید

نوع نمونه، تعداد، هدف آزمایش، خروجی مورد انتظار و محدودیت زمانی از اطلاعاتی هستند که به بررسی و برآورد دقیق‌تر درخواست کمک می‌کنند.